Такая же проблема. iMac 27 5k + второй монитор.
При попытке захвата - области выделения остаются, можно сделать захват, но сами оба экрана полностью темные.
Если захват все же делаешь "вслепую" - то скриншот нормальный (не темного экрана, а обычного) 
Т.е проблема именно в том, что на моменте выделения приходится делать это вслепую, не видно экраны.

Прошло, смотрю, два года. Удалось решить проблему?