Очень похожие симптомы, Ubuntu 16.04 x64. Только что поставил .deb 64bit 3.0.9. Стучитесь в скайп (pavel_sutyrin), отладим. Спасибо!

Да, на двух мониторах пользоваться нельзя: работает только на одном из двух. На втором - можно сделать скриншот, но панель с редактором не показывается. (Проверено на Ubuntu 16.04 свежей)